]> git.treefish.org Git - phys/latlib.git/commitdiff
...
authorAlex Schmidt <alex@treefish.org>
Wed, 17 Apr 2013 09:41:32 +0000 (11:41 +0200)
committerAlex Schmidt <alex@treefish.org>
Wed, 17 Apr 2013 09:41:32 +0000 (11:41 +0200)
configcache.cpp
configcache.h
hypercache.cpp
hypercache.h
o815/CMakeLists.txt
o815/o815.cpp
o815/o815.h
o815/obs.cpp
o815/sim.cpp [new file with mode: 0644]

index a3490ad9574337c6ea59d4cee053dead0afb48bf..d45e4d661552340960c5cbb09d9cae4fcd7f23a8 100644 (file)
@@ -10,8 +10,8 @@
 #define HEADER_READLAST 2
 
 configcache::configcache(const string& cacheid, const int& nequi, const int& nskip, const string& datadir, char **configmem, const int& configMemSize, const int& cachemode,
 #define HEADER_READLAST 2
 
 configcache::configcache(const string& cacheid, const int& nequi, const int& nskip, const string& datadir, char **configmem, const int& configMemSize, const int& cachemode,
-                        writeout *out_a){
-  out = out_a;
+                        ostream *_log){
+  log = _log;
 
   NEQUI = nequi;
   NSKIP = nskip;
 
   NEQUI = nequi;
   NSKIP = nskip;
@@ -131,19 +131,19 @@ int configcache::readHeader()
        return HEADER_READOK;
       }
       else {
        return HEADER_READOK;
       }
       else {
-       if(out) *out->log << "CCACHE: Could not read heade-data! Closing dat-file: " << openFileDesc.filename << endl << flush;
+       if(log) *log << "CCACHE: Could not read heade-data! Closing dat-file: " << openFileDesc.filename << endl << flush;
        inFile.close();
        return HEADER_READERR;
       }
     }
     else {
        inFile.close();
        return HEADER_READERR;
       }
     }
     else {
-      if(out) *out->log << "CCACHE: Could not read headerid-hash! Closing dat-file: " << openFileDesc.filename << endl << flush;
+      if(log) *log << "CCACHE: Could not read headerid-hash! Closing dat-file: " << openFileDesc.filename << endl << flush;
       inFile.close();
       return HEADER_READERR;
     }
   }
   else {
       inFile.close();
       return HEADER_READERR;
     }
   }
   else {
-    if(out) *out->log << "CCACHE: Could not read header size. Closing dat-file: " << openFileDesc.filename << endl << flush;
+    if(log) *log << "CCACHE: Could not read header size. Closing dat-file: " << openFileDesc.filename << endl << flush;
     inFile.close();
     return HEADER_READERR;
   }
     inFile.close();
     return HEADER_READERR;
   }
@@ -201,11 +201,11 @@ int configcache::readConfig(vector<unsigned long> *excludeFileHashes)
            }
              
        if ( ! excludethisfile ) {
            }
              
        if ( ! excludethisfile ) {
-         if(out) *out->log << "CCACHE: Opening dat-file: " << inFiles.back().filename << endl << flush;
+         if(log) *log << "CCACHE: Opening dat-file: " << inFiles.back().filename << endl << flush;
          inFile.open( (DATADIR + "/" + inFiles.back().filename).c_str(), std::ios::binary );
        }
        else
          inFile.open( (DATADIR + "/" + inFiles.back().filename).c_str(), std::ios::binary );
        }
        else
-         if(out) *out->log << "CCACHE: Excluded dat-file: " << inFiles.back().filename << endl << flush;
+         if(log) *log << "CCACHE: Excluded dat-file: " << inFiles.back().filename << endl << flush;
        
        inFiles.pop_back();
        
        
        inFiles.pop_back();
        
@@ -219,7 +219,7 @@ int configcache::readConfig(vector<unsigned long> *excludeFileHashes)
       if( inFile.is_open() ) 
        {
          if (openFileDesc.doVirtualEquilibration) {
       if( inFile.is_open() ) 
        {
          if (openFileDesc.doVirtualEquilibration) {
-           if(out) *out->log << "CCACHE: Trying virtual equilibration." << endl << flush;
+           if(log) *log << "CCACHE: Trying virtual equilibration." << endl << flush;
            openFileDesc.doVirtualEquilibration = false;
            for (int iskip=0; iskip < (NEQUI-openFileDesc.nequi)/openFileDesc.nskip; iskip++) {
              if( readFullBlock(tmpConfig, configSize) != configSize || ! inFile.is_open() )
            openFileDesc.doVirtualEquilibration = false;
            for (int iskip=0; iskip < (NEQUI-openFileDesc.nequi)/openFileDesc.nskip; iskip++) {
              if( readFullBlock(tmpConfig, configSize) != configSize || ! inFile.is_open() )
@@ -237,7 +237,7 @@ int configcache::readConfig(vector<unsigned long> *excludeFileHashes)
              return -1;
            }
          else {
              return -1;
            }
          else {
-           if(out) *out->log << "CCACHE: Could not read configuration. Closing dat-file: " << openFileDesc.filename << endl << flush;
+           if(log) *log << "CCACHE: Could not read configuration. Closing dat-file: " << openFileDesc.filename << endl << flush;
            inFile.close();
          }
        }
            inFile.close();
          }
        }
@@ -350,15 +350,15 @@ int configcache::readDataToMem(char *tmpData, long unsigned int dataSize)
 
   try { readturn = boost::iostreams::read(*inBuffer, tmpData, dataSize); }
   catch(boost::iostreams::bzip2_error& error) { 
 
   try { readturn = boost::iostreams::read(*inBuffer, tmpData, dataSize); }
   catch(boost::iostreams::bzip2_error& error) { 
-    if(out) *out->log << "CCACHE: Caught bzip2 exception with error code: " << error.error() << endl << flush;
+    if(log) *log << "CCACHE: Caught bzip2 exception with error code: " << error.error() << endl << flush;
     inFile.close();
   } 
   catch (std::exception const& ex) {
     inFile.close();
   } 
   catch (std::exception const& ex) {
-    if(out) *out->log << "CCACHE: Caught exception: " << ex.what() << endl << flush;
+    if(log) *log << "CCACHE: Caught exception: " << ex.what() << endl << flush;
     inFile.close();
   }
   catch( ... ) {
     inFile.close();
   }
   catch( ... ) {
-    if(out) *out->log << "CCACHE: Caught unknown exception while reading." << endl << flush;
+    if(log) *log << "CCACHE: Caught unknown exception while reading." << endl << flush;
     inFile.close();
   }
 
     inFile.close();
   }
 
index f07ccf50f1cb51ae682f5dc17425fa4e70285243..d79afa685d802b2132e9daa41d82a6941a3d41b5 100644 (file)
@@ -5,6 +5,7 @@
 #include <string>
 #include <fstream>
 #include <sstream>
 #include <string>
 #include <fstream>
 #include <sstream>
+#include <ostream>
 
 #include <boost/iostreams/filtering_streambuf.hpp>
 #include <boost/iostreams/stream.hpp>
 
 #include <boost/iostreams/filtering_streambuf.hpp>
 #include <boost/iostreams/stream.hpp>
@@ -12,8 +13,6 @@
 #include <boost/iostreams/device/array.hpp>
 #include <boost/iostreams/copy.hpp>
 
 #include <boost/iostreams/device/array.hpp>
 #include <boost/iostreams/copy.hpp>
 
-#include "writeout.h"
-
 #define CACHE_MODE_DISABLED 0
 #define CACHE_MODE_READ 1
 #define CACHE_MODE_FULL 2
 #define CACHE_MODE_DISABLED 0
 #define CACHE_MODE_READ 1
 #define CACHE_MODE_FULL 2
@@ -37,7 +36,7 @@ class configcache{
  public:
   ~configcache();
   configcache(const string& cacheid, const int& nequi, const int& nskip, const string& datadir, char **configmem, const int& configMemSize, 
  public:
   ~configcache();
   configcache(const string& cacheid, const int& nequi, const int& nskip, const string& datadir, char **configmem, const int& configMemSize, 
-             const int& cachemode=CACHE_MODE_FULL, writeout *out_a=NULL);
+             const int& cachemode=CACHE_MODE_FULL, ostream *_log=NULL);
   int readConfig(vector<unsigned long> *excludeFileHashes=NULL);
   void writeConfig();
   void addPara(const string& parid, const double& val=0);
   int readConfig(vector<unsigned long> *excludeFileHashes=NULL);
   void writeConfig();
   void addPara(const string& parid, const double& val=0);
@@ -49,6 +48,7 @@ class configcache{
   static unsigned long hash(const string& str);
 
  private:
   static unsigned long hash(const string& str);
 
  private:
+  ostream* log;
   infiledesc openFileDesc;
   void finishOutFile();
   int getParIndex(const string& parid);
   infiledesc openFileDesc;
   void finishOutFile();
   int getParIndex(const string& parid);
@@ -62,8 +62,6 @@ class configcache{
   ofstream outFile;
   ifstream inFile;
 
   ofstream outFile;
   ifstream inFile;
 
-  writeout *out;
-
   stringstream outFileName;
 
   int readnum;
   stringstream outFileName;
 
   int readnum;
index 6c8e190a032ead4876f6985ce0bb9a374c2c188e..734a640469649d31b8837bed4a7c1a4ccf4a76e6 100644 (file)
@@ -5,16 +5,16 @@ vector<hypercache::para> hypercache::delayedParaAdd;
 vector<hypercache::para> hypercache::delayedParaSet;
 string hypercache::activeCFile = "";
 vector<unsigned long> hypercache::parentConfigs;
 vector<hypercache::para> hypercache::delayedParaSet;
 string hypercache::activeCFile = "";
 vector<unsigned long> hypercache::parentConfigs;
-writeout *hypercache::out = NULL;
+ostream* hypercache::log;
 vector<configcache*> hypercache::Os;
 
 void hypercache::initCache(configcache **cache,
                           const string& cacheid, const int& nequi, const int& nskip, const string& datadir, 
 vector<configcache*> hypercache::Os;
 
 void hypercache::initCache(configcache **cache,
                           const string& cacheid, const int& nequi, const int& nskip, const string& datadir, 
-                          char **configmem, const int& configMemSize, const int& cachemode, writeout *out_a) {
-  if ( out_a != NULL )
-    out = out_a;
+                          char **configmem, const int& configMemSize, const int& cachemode, ostream* _log) {
+  if ( _log != NULL )
+    log = _log;
   
   
-  *cache = new configcache(cacheid, nequi, nskip, datadir, configmem, configMemSize, cachemode, out_a);
+  *cache = new configcache(cacheid, nequi, nskip, datadir, configmem, configMemSize, cachemode, log);
   
   for (vector<para>::iterator parit=delayedParaAdd.begin(); parit != delayedParaAdd.end(); ++parit)
     (*cache)->addPara(parit->parid, parit->val);
   
   for (vector<para>::iterator parit=delayedParaAdd.begin(); parit != delayedParaAdd.end(); ++parit)
     (*cache)->addPara(parit->parid, parit->val);
index 523cc56e8831bedbc44d63046d72dd276391a73a..dd2ce0b493e152387030727137bbef5cb9e36a0b 100644 (file)
@@ -2,6 +2,7 @@
 #define HYPERCACHE_H
 
 #include <iostream>
 #define HYPERCACHE_H
 
 #include <iostream>
+#include <ostream>
 
 #include "configcache.h"
 
 
 #include "configcache.h"
 
@@ -10,14 +11,14 @@ using namespace std;
 class hypercache {
  public:
   static int initO(const string& cacheid, const int& nequi, const int& nskip, const string& datadir, 
 class hypercache {
  public:
   static int initO(const string& cacheid, const int& nequi, const int& nskip, const string& datadir, 
-                  char **configmem, const int& configMemSize, const int& cachemode=CACHE_MODE_FULL, writeout *out_a=NULL) {
+                  char **configmem, const int& configMemSize, const int& cachemode=CACHE_MODE_FULL, ostream *_log=NULL) {
     Os.push_back(NULL);
     Os.push_back(NULL);
-    initCache(&Os.back(), cacheid, nequi, nskip, datadir, configmem, configMemSize, cachemode, out_a);
+    initCache(&Os.back(), cacheid, nequi, nskip, datadir, configmem, configMemSize, cachemode, _log);
     return Os.size()-1;
   }
   static void initC(const string& cacheid, const int& nequi, const int& nskip, const string& datadir, 
     return Os.size()-1;
   }
   static void initC(const string& cacheid, const int& nequi, const int& nskip, const string& datadir, 
-                   char **configmem, const int& configMemSize, const int& cachemode=CACHE_MODE_FULL, writeout *out_a=NULL) {
-    initCache(&C, cacheid, nequi, nskip, datadir, configmem, configMemSize, cachemode, out_a);
+                   char **configmem, const int& configMemSize, const int& cachemode=CACHE_MODE_FULL, ostream *_log=NULL) {
+    initCache(&C, cacheid, nequi, nskip, datadir, configmem, configMemSize, cachemode, _log);
   }
   
   static void addPara(const string& parid, const double& val=0);
   }
   
   static void addPara(const string& parid, const double& val=0);
@@ -41,7 +42,7 @@ class hypercache {
 
   static void initCache(configcache **cache,
                        const string& cacheid, const int& nequi, const int& nskip, const string& datadir, 
 
   static void initCache(configcache **cache,
                        const string& cacheid, const int& nequi, const int& nskip, const string& datadir, 
-                       char **configmem, const int& configMemSize, const int& cachemode=CACHE_MODE_FULL, writeout *out_a=NULL); 
+                       char **configmem, const int& configMemSize, const int& cachemode=CACHE_MODE_FULL, ostream* _log=NULL); 
 
   static void initCache( configcache **cache,
                         const string& cacheid, char **configmem, const int& configMemSize, const int& cachemode=CACHE_MODE_FULL);
 
   static void initCache( configcache **cache,
                         const string& cacheid, char **configmem, const int& configMemSize, const int& cachemode=CACHE_MODE_FULL);
@@ -50,12 +51,12 @@ class hypercache {
   static vector<configcache*> Os;
   static vector<para> delayedParaAdd;
   static vector<para> delayedParaSet;
   static vector<configcache*> Os;
   static vector<para> delayedParaAdd;
   static vector<para> delayedParaSet;
-  static writeout *out;
 
   static string fileOfPath(const string& dressedfile);
   static string activeCFile;
   static vector<unsigned long> parentConfigs;
   static void addParentConfig(const unsigned long *parentconfig);
 
   static string fileOfPath(const string& dressedfile);
   static string activeCFile;
   static vector<unsigned long> parentConfigs;
   static void addParentConfig(const unsigned long *parentconfig);
+  static ostream* log;
 };
 
 #endif
 };
 
 #endif
index 8431e25c9be367582591df5630b32c766ffa0a73..49fa0814fa6d55b317e4885e575334420be121a3 100644 (file)
@@ -9,5 +9,5 @@ include_directories(${MPI_INCLUDE_PATH} ../)
 
 SET(CMAKE_BUILD_TYPE Release)
 
 
 SET(CMAKE_BUILD_TYPE Release)
 
-add_library(o815 o815.cpp obs.cpp)
-target_link_libraries(o815 ${MPI_LIBRARIES} lat_paraq lat_writeout)
+add_library(o815 o815.cpp obs.cpp sim.cpp)
+target_link_libraries(o815 ${MPI_LIBRARIES} lat_paraq lat_writeout lat_hypercache lat_progress)
index 9fcae16949a293d6c1ab4af25ca6678a19843345..cf461ba12bc238749befb8e584e02a14e1701f27 100644 (file)
@@ -51,15 +51,22 @@ o815::o815(int argc, char **argv, const string& _programid) {
 }
 
 void o815::mainLoop() {
 }
 
 void o815::mainLoop() {
+  *out->log << "OBS: Starting main loop." << endl;
+
   for (vector<obs*>::iterator obsit = observables.begin(); obsit != observables.end(); ++obsit) {
     (*obsit)->start();
   }
   for (vector<obs*>::iterator obsit = observables.begin(); obsit != observables.end(); ++obsit) {
     (*obsit)->start();
   }
+
+  //while( nextParas() ) {
+  //}
   
   
+  /*
   for (int i=0; i<100; i++) {
     for (vector<obs*>::iterator obsit = observables.begin(); obsit != observables.end(); ++obsit) {
       (*obsit)->meas();
     } 
   }
   for (int i=0; i<100; i++) {
     for (vector<obs*>::iterator obsit = observables.begin(); obsit != observables.end(); ++obsit) {
       (*obsit)->meas();
     } 
   }
+  */
 
   for (vector<obs*>::iterator obsit = observables.begin(); obsit != observables.end(); ++obsit) {
     (*obsit)->finish();
 
   for (vector<obs*>::iterator obsit = observables.begin(); obsit != observables.end(); ++obsit) {
     (*obsit)->finish();
@@ -146,3 +153,20 @@ o815::~o815() {
   delete out;
   MPI_Finalize();
 }
   delete out;
   MPI_Finalize();
 }
+
+int o815::nextParas()
+{
+  if( paraQ->nextParas() ) {
+    /*
+    setB( (*paraQ)["beta"] );
+    setK( (*paraQ)["kappa"] );
+    setL( (*paraQ)["lambda"] );
+    setM1( (*paraQ)["mu1"] );
+    setM2( (*paraQ)["mu2"] );
+    */
+
+    return 1;
+  }
+  else
+    return 0;
+}
index 577691736cddae445bcc207b7691cb0c19042936..2f12fc5162b209fe263d4e2f355e31acc24bacc9 100644 (file)
@@ -18,7 +18,7 @@ class o815 {
 
   class obs {
   public:
 
   class obs {
   public:
-    obs(const string& _obsid, const string& _datadesc, o815 *_O815, char *_obsmem, const int& _obsmemSize);
+    obs(const string& _obsid, const string& _datadesc, o815 *_O815, const int& _obsmemSize);
     void finish();
     void meas();
     void start();
     void finish();
     void meas();
     void start();
@@ -30,9 +30,24 @@ class o815 {
   protected:
     o815 *O815;
     char *obsMem;
   protected:
     o815 *O815;
     char *obsMem;
-    ostream *oout;
-    ostream *olog;
-    string obsid, datadesc;
+    string obsid, simid, datadesc;
+    ostream *out, *log;
+    int ocid;
+  };
+
+  class sim {
+  public:
+    sim(o815 *_O815, const int& _confmemSize);
+    void nextConfig();
+    bool toEquilibrate;
+    char *confMem;
+  private:
+    virtual void _reset()=0;
+    virtual void _makeSweep(int nsweep)=0;
+  protected:
+    o815 *O815;
+    ostream *log;
+    int nequi, nskip;
   };
 
   struct {
   };
 
   struct {
@@ -52,6 +67,7 @@ class o815 {
   paraq *paraQ;
   writeout *out;
   vector<obs*> observables;
   paraq *paraQ;
   writeout *out;
   vector<obs*> observables;
+  sim* Sim;
   void mainLoop();
   string headMaster();
 
   void mainLoop();
   string headMaster();
 
@@ -61,6 +77,7 @@ private:
   static void listArg(int *target, int tlen, char *listarg);
   void parseArgs(int argc, char **argv);
   string programid;
   static void listArg(int *target, int tlen, char *listarg);
   void parseArgs(int argc, char **argv);
   string programid;
+  int nextParas();
 };
 
 #endif
 };
 
 #endif
index c927935d565916572f42f4395df3863693df6510..70aa8b646a6c116b575c75a09bfc7bc16c224f4b 100644 (file)
@@ -1,13 +1,15 @@
 #include "o815.h"
 
 #include "o815.h"
 
+#include "latlib/hypercache.h"
+
 void o815::obs::finish() {
   _finish();
 }
 
 void o815::obs::start() {
   if(O815->rank==0) {
 void o815::obs::finish() {
   _finish();
 }
 
 void o815::obs::start() {
   if(O815->rank==0) {
-    *oout << "#" << obsid << O815->headMaster() << endl << flush;
-    *oout << "#" << obsid << O815->headMaster() << "-" << datadesc << endl << flush;
+    *out << "#" << O815->programid << "-" << obsid << O815->headMaster() << endl << flush;
+    *out << "#" << O815->programid << "-" << obsid << O815->headMaster() << "-" << datadesc << endl << flush;
   }
 
   if (O815->comargs.outdir=="")
   }
 
   if (O815->comargs.outdir=="")
@@ -20,12 +22,15 @@ void o815::obs::meas() {
   _meas(true);
 }
 
   _meas(true);
 }
 
-o815::obs::obs(const string& _obsid, const string& _datadesc, o815 *_O815, char *_obsmem, const int& _obsmemSize) {
+o815::obs::obs(const string& _obsid, const string& _datadesc, o815 *_O815, const int& obsmemSize) {
   obsid = _obsid;
   O815 = _O815;
   datadesc = _datadesc;
   obsid = _obsid;
   O815 = _O815;
   datadesc = _datadesc;
-  
   O815->out->newsub(obsid);
   O815->out->newsub(obsid);
-  oout = O815->out->out[obsid];
-  olog = O815->out->log;
+
+  out = O815->out->out[obsid];
+  log = O815->out->log;
+
+  ocid = hypercache::initO(O815->programid + "-" + obsid, O815->comargs.nequi, O815->comargs.nskip,
+                          O815->comargs.obscache.first, &obsMem, obsmemSize, O815->comargs.obscache.second, log);
 }
 }
diff --git a/o815/sim.cpp b/o815/sim.cpp
new file mode 100644 (file)
index 0000000..2e68ae2
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,35 @@
+#include "o815.h"
+
+#include "latlib/hypercache.h"
+#include "latlib/progress.h"
+
+o815::sim::sim(o815 *_O815, const int& confmemSize) {
+  O815 = _O815;
+  log = O815->out->log;
+  hypercache::initC(O815->programid, O815->comargs.nequi, O815->comargs.nskip, O815->comargs.confcache.first, &confMem, confmemSize, O815->comargs.confcache.second, log);
+  toEquilibrate = true;
+  nequi = O815->comargs.nequi;
+  nskip = O815->comargs.nskip;
+}
+
+void o815::sim::nextConfig() {
+  int nequileft = hypercache::readC();
+
+  if ( nequileft != -1 ) {
+    if(toEquilibrate) {
+      _reset();
+      *log << "SIM: Starting equilibration." << endl << flush;
+      if (nequileft != nequi)
+       *log << "SIM: " << nequileft << " of " << nequi << " equilibration steps left after virtual equilibration." << endl << flush;
+      progress equiProg(nequileft);
+      for( int iequi=0; iequi<nequileft; iequi++ ) {
+       _makeSweep(1);
+       while( equiProg.madeStep(iequi) ) *log << "SIM: " << equiProg.done()*100 << "% of equilibration done." << endl << flush;
+      }
+    }  
+    _makeSweep(nskip);
+    hypercache::writeC();
+  }
+  
+  toEquilibrate = false;
+}